Publications du Service canadien des forêts

Variation in the mitochondrial DNA of the potential biological control agent Chondrostereum purpureum. 1999. Ramsfield, T.D.; Shamoun, S.F.; Punja, Z.K.; Hintz, W.E. Canadian Journal of Botany 77: 1490-1498.

Année : 1999

Disponible au : Centre de foresterie du Pacifique

Numéro de catalogue : 5393

La langue : Anglais

Disponibilité : PDF (demande par courriel)

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Résumé

Les auteurs ont extrait et purifié l'ADN mitochondrial (ADNmt) du Chondrostereum purpureum; ses dimensions varient de 51,8 à 66,4 kb. A partir d'isolats uniques provenant de la Colombie britannique, de l'Alberta, de la Finlande, de la Hollande et de la Nouvelle-Zélande on retrouve des patrons de restriction identiques pour le BamHI ADNmt, donnant un génôme de 63,8 kb. Cependant, un autre isolat de la Colombie britannique et un isolat de la Suisse montrent des patrons de bandes différents, donnant des génômes de 66,4 kb et 51,8 kb, respectivement. Les auteurs ont développé un test pour la région amplifiée caractérisée par la séquence (SCAR) basée sur la polymérisation en chaîne, pour tamiser rapidement une plus grande population de 84 isolats provenant de l'Amérique du nord, de l'Europe et de la Nouvelle-Zélande. Deux SCARs, un codant pour le gène NADH 4 (3 kb) et un second codant pour les gènes de l'ATPase VI et du cytochrome b (5,1 kb), ont été traités avec 24 enzymes de restriction. On ne trouve pas de polymorphisme dans le SCAR de la NADH 4, alors qu'un polymorphisme unique est décelé par le NsiI dans le SCAR contenant l'ATPase et le cytochrome b. Deux haplotypes mitochondriaux, qui sont distribués dans l'ensemble de la population, one été identifiés. Le coëficient de coancestrie (q) calculé pour toutes les sous-populations de la population échantillonnée est de 0,0353. Le degré de diversité observé dans l'ADNmt du C. purpureum suggère que la possibilité d'une introduction aléotoire de nouveaux gènes mitochondriaux, suite à l'application du champignon pour la maîtrise biologique, est relativement faible.