Publications du Service canadien des forêts

Identification and characterization of the WRKY transcription factor family in Pinus monticola. 2009. Liu, J.-J.; Ekramoddoullah, A.K.M. Genome 52(1): 77-88.

Année : 2009

Disponible au : Centre de foresterie du Pacifique

Numéro de catalogue : 29422

La langue : Anglais

Disponibilité : PDF (télécharger)

Disponible sur le site Web de la revue ou du journal.
DOI : 10.1139/G08-106

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Résumé

La famille de gènes WRKY représente un groupe à la fois ancien et très complexe de facteurs de transcription qui sont impliqués dans de nombreux processus du développement et des réactions de défense chez les plantes. À ce jour, la plupart des protéines WRKY ont été identifiées chez quelques espèces d’angiospermes. L’identification de gènes WRKY chez un conifère contribuerait à une connaissance plus complète des processus évolutifs et adaptatifs menant à l’acquisition de fonctions au sein de cette superfamille chez les plantes. Les auteurs ont réalisé des amplifications PCR sur de l’ADN génomique afin de cloner des séquences WRKY chez le pin argenté (Pinus monticola), l’une des espèces de conifères les plus importantes et qui est menacée par la rouille vésiculeuse du pin blanc (Cronartium ribicola). Au total, 83 séquences WRKY du P. monticola (PmWRKY) ont été identifiées à l’aide d’amorces dégénérées ciblant le domaine WRKY. Une analyse phylogénétique a montré que les membres de la famille PmWRKY logent au sein des quatre groupes majeurs (1, 2a+2b, 2c et 2d+2e) décrits chez Arabidopsis et le riz. En raison de la grande diversité génétique au sein de la famille des PmWRKY, une technique AFLP modifiée a été employée pour détecter du polymorphisme au sein de cette famille. Entre 17% et 35% de tous les amplicons PCR obtenus dans ces profils AFLP étaient polymorphes. Parmi ceux-ci, un marqueur WRKY-AFLP était lié à un gène majeur de résistance (Cr2) au C. ribicola. Les résultats de cette étude fournissent les informations génomiques de base pour une famille de gènes WRKY chez un conifère. Cette avancée pave la voie en vue de l’élucidation des mécanismes d’évolution des gènes chez les plantes et de la découverte des rôles précis des PmWRKY dans le développement et les réactions de défense chez les conifères.