Publications du Service canadien des forêts

Poplar leaf rusts: model pathogens for a model tree. 2007. Feau, N.; Joly, D.L.; Hamelin, R.C. Can. J. Bot. 85: 1127-1135.

Année : 2007

Disponible au : Centre de foresterie des Laurentides

Numéro de catalogue : 28063

Langue : Anglais

Disponibilité au SCF : PDF (demande par courriel)

Disponible sur le site Web de la revue ou du journal.
DOI (identifiant d'objet numérique) : 10.1139/B07-102

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Résumé

Avec la disponibilité de la séquence complète du génome de l'arbre modèle en foresterie, Populus trichocarpa Torr. & A. Gray, et du séquençage en cours d'un de ses agents pathogènes, le Melampsora larici-populina Kleb., la recherche sur l'interaction rouille-peuplier est entrée dans l'ère de la génomique. Les recherches actuelles en génomique chez les peupliers visent à établir des liens entre les loci identifiés par cartographie génétique et des gènes potentiellement identifiés pour leur implication dans la résistance à ces agents pathogènes. Les interactions entre ces gènes de résistance et des effecteurs des rouilles restent toutefois inconnues. Dans ce contexte, les ressources en génomique développées pour les Melampsora spp. devraient conduire à la compréhension des bases moléculaires du pouvoir pathogène chez ces champignons, en facilitant l'isolation de gènes impliqués dans la pathogénicité. Une approche basée sur différents modes d'analyses de séquences a été développée et doit mener à l'identification de tels gènes. La stratégie mise en place tire avantage des ressources disponibles, en combinant les banques d'ESTs, l'exploitation de ces données de transcriptomique au moyen d'outils de bioinformatique pour la recherche de protéines sécrétées et la génomique comparative, tant au niveau intra- qu'inter-spécifique, pour la détection de sélection positive. Plusieurs gènes candidats ont pu être identifiés au moyen de cette approche. À plus long terme, ces candidats découverts in silico seront validés au moyen d'analyses fonctionnelles.

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