Publications du Service canadien des forêts

Biodiversity of foliar fungal endophytes in white spruce (Picea glauca) from southern Québec. 2006. Stefani, F.O.P.; Bérubé, J.A. Can. J. Bot. 84: 777-790.

Année : 2006

Disponible au : Centre de foresterie des Laurentides

Numéro de catalogue : 26625

La langue : Anglais

Disponibilité au SCF : PDF (demande par courriel)

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Abstract

L'objectif de cette étude était de définir la biodiversité des endophytes foliaires de l'épinette blanche (Picea glauca (Moench) Voss), afin d'identifier un ensemble d'espèces de référence pour des études comparatives futures évaluant l'impact des pratiques forestières. Nous rapportons pour la première fois la flore fongique endophytique foliaire des épinettes blanches, à partir de l'analyse de 280 aiguilles provenant de sept peuplements du sud du Québec. Des champignons endophytes foliaires ont été observés sur 53,2 % des aiguilles stérilisées. L'identification moléculaire a été réalisée par amplification, digestion et séquençage de la région ITS de l'ADN ribosomique. Des isolats de chaque groupe de restriction ont été séquencés. Ces séquences ont été comparées à des séquences de référence de GenBank. L'identification moléculaire a été réalisée par l'analyse phylogénétique (maximum de parcimonie et analyse bayesienne) des séquences des isolats et des séquences similaires de GenBank. Les relations entre les groupes morphologiques, les groupes de restriction et les groupes de séquences ont été suivies : 23 groupes morphologiques ont été associés à 14 groupes de séquences. Ce suivi montre que les groupes morphologiques sont des indicateurs inadéquats pour estimer la diversité des espèces. Parmi les 141 champignons endophytes isolés, 75,15 % d'entre eux présentent une forte similitude de séquence avec Lophodermium piceae, 10,95 % des isolats sont similaires à une espèce inconnue du genre Mycosphaerella et 5,5 % des isolats sont similaires à deux espèces du genre Hypoxylon. La distribution, l'incidence et la signification biologique des endophytes foliaires répertoriés dans ce projet sont discutées.